Создание Национальной коллекции микроорганизмов в Республике Беларусь является одним из приоритетных направлений. В настоящее время коллекция получила разрешение приобрести статус Международного депозитария и присоединиться к Будапештскому договору о международном признании депонирования микроорганизмов для целей патентной процедуры.

Коллекция вирусов, созданная на базе НИИ ЭМ, включает в себя эталонные вирусные агенты, а также оригинальные изоляты, полученные в ходе научных исследований, в том числе и с измененными генетическими свойствами. Отличительной чертой коллекции является депонирование микроорганизмов, чьи свойства опасны или могут быть опасны для здоровья человека или окружающей среды. В настоящее время в коллекционном фонде института поддерживаются более 40 видов вирусных агентов, которые сохраняются как в лиофильно высушенном, так и в жидком виде.

При проведении депонирования учитывается Будапештский договор «О международном признании депонирования для целей патентной процедуры», подписанный 28.04.77 г. и инструкции к этому договору.

Первоначальное депонирование может осуществляться как физическими, так и юридическими лицами. При депонировании депозитор представляет:
– письмо с просьбой о депонировании (с указанием типа депонирования);
– паспорт на передаваемый штамм (в двух экземплярах в печатном виде по форме, принятой в Национальной коллекции микроорганизмов), подписанный депозитором и, если депозитор юридическое лицо, заверенный печатью;
– заключение о непатогенности или патогенности депонируемого микроорганизма;
– образцы культур микроорганизмов: 10 лиофилизированных образцов и к ним по 2 ампулы референс-сывороток;
– плазмиды (в виде очищенной ДНК): 10 образцов (100 нг каждый).