Цель исследования - изучить влияние области димеризации ретровирусного генома на эффективность гомологичной рекомбинации, а также преимущественное образование гомодиплоидных геномов у вируса лейкемии мышей Молони (Mo-MuLV-Moloney murine leukemia virus).

Для ретровирусов характерна высокая частота гомологичной рекомбинации, которая обеспечивает реассоциацию мутаций и значительно увеличивает изменчивость в вирусных популяциях. Так как ретровирусный геном является диплоидным, т.е. состоит из двух идентичных РНК молекул, рекомбинантные провирусы могут быть образованы, когда два генетически-различных РНК-генома будут упакованы в сходную вирусную частицу.

Используя ретровирусные векторы в состав лидерных районов которых были введены генетические маркеры, изучена частота гомологичной рекомбинации в области DLS в сравнении с окружающими вирусными последовательностями. Как показали результаты экспериментов, частота гомологичной рекомбинации на исследованных участках лидерного района практически не отличалась. Таким образом, наличие выраженной вторичной структуры, а также сайтов физического взаимодействия между геномными молекулами РНК, не являются единственными детерминантами рекомбинационно-активного участка ретровирусного генома.

Показано, что область димеризации не имеет определяющего значения для укладки геномных молекул РНК в составе вирусного нуклеокапсидного комплекса, так как в ее отсутствие вирус способен реплицироваться, частота рекомбинационных переходов сохраняется на прежнем уровне. Результаты указывают на преимущественное формирование гомодиплоидных геномов у Mo-MuLV, связанное с локальным транспортом вирусных молекул РНК из ядра к месту сборки вирусных частиц в цитоплазму клетки. Выявлено, что Mo-MuLV и HIV-1 используют различные механизмы транспорта геномных молекул РНК. Вирусные последовательности, вовлеченные в этот процесс, представляют интерес для создания, так называемых, «химерных» вирусов. Использование последовательностей Mo-MuLV, ответственных за транспорт геномных молекул РНК для получения генно-инженерных вакцин и векторных систем на основе генома HIV-1, позволит значительно повысить их безопасность.