УДК: 004.42:577.17+576.8.097.1
Год издания: 2008

КОМПЬЮТЕРНАЯ ПРОГРАММА ДЛЯ РАСЧЕТА ПОКАЗАТЕЛЕЙ РЕЦЕПТОРНОГО ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ НА ОСНОВЕ СКЭТЧАРДОВСКИХ ГРАФИКОВ

Платонова Т.Ю.Митюкова Т.А.Платонов М.В.Дрозд В.М.Леонова Т.А.
Рубрики: 76.03.31
Белорусская медицинская академия последипломного образования
Тема НИР: изучить особенности рецепции тироксина у пациентов с первичным гипотиреозом и разработать протокол коррекции выявленных нарушений.
Сроки выполнения НИР: январь 2006 г. - декабрь 2008 г.
Научный руководитель: д-р мед. наук, проф. В.М. Дрозд.
Источник финансирования: госбюджет.

Исследователи, занимающиеся изучением пара­метров связывания гормонов с рецепторными бел­ками, как правило, используют меченые соединения (гормоны), которые позволяют детектировать долю гормонов, связавшуюся с рецептором (B ). Арифме­тическим путем можно рассчитать концентрацию свободного несвязавшегося гормона (F). Конечное соотношение концентраций свободного гормона, свободного белка-рецептора и комплекса гормон-рецептор в условиях установившегося динами­ческого равновесия зависит, с одной стороны, от концентраций взаимодействующих соединений, а с другой - от степени сродства гормона к рецеп­тору. Степень сродства гормона к рецептору (аф­финность) характеризуется величиной равновес­ной константы ассоциации (Ка). Данный показа­тель является важнейшей характеристикой гормон-рецепторного взаимодействия. После получения ряда экспериментальных значений B и F можно построить различные типы кривых связывания, экстраполяция которых позволяет найти интересу­ющие нас величины Ка и количества связывающих мест N. Для этих целей, как правило, используют построение и анализ кривых Скэтчарда.

Для выполнения анализа необходимо провести серию реакций связывания гормонов с рецепто­рами при нескольких различных исходных кон­центрациях гормона в растворе, которые можно обозначить как Т1, Т2, Т3, Т4 и т. д. Зная ряд ис­ходных общих концентраций гормона в растворе (Т) и получив экспериментальные значения В (для каждой концентрации Т), можно рассчитать соот­ветствующие им концентрации F и соотношения B/F, а затем построить график, где по оси X отло­жить экспериментально полученные значения В, а по оси Y - соответствующие этим точкам расчет­ные значения B/F. Если в растворе присутствует один гормон и один рецептор, то скэтчардовская зависимость будет линейной. На практике мы убе­дились, что при работе с исходными концентра­циями гормона (Т) в интервале 1-20 пмоль/л мы получаем линейную зависимость между величи­нами В и B/F. Точка пересечения графика с осью Х дает значение N (количество связывающих мест в растворе в пмоль/л), расчетным путем можно най­ти значение n - количество связывающих мест на одну клетку. Точка пересечения графика с осью Y дает величину Ка N (индекс связывания). По­скольку построение графиков вручную является крайне трудоемким процессом и дает неточные результаты, то была поставлена задача создать компьютерную программу, которая бы могла в ав­томатическом режиме выполнять все вышеописан­ные действия и давала бы на выходе все интересу­ющие нас параметры связывания: Ка, N, n, Ка N.

Программа написана на языке С++, является универсальной и может использоваться в хими­ческих и биохимических исследованиях, где не­обходимо выполнять построение графиков в коор­динатах Скэтчарда (расчет параметров уравнения регрессии). Она обладает возможностью накопле­ния данных, корректировки; имеет поисковик; со­вместима с другими базами; защищена паролем; предусмотрены маски ввода информации; провер­ки корректности вводимой информации.

База данных состоит из нескольких частей: ре­гистрационных данных; показателей, характеризу­ющих процесс специфического рецепторного взаи­модействия; равновесной константы аффинности.

Для построения графиков в координатах Скэт­чарда необходимо рассчитать параметры уравнения регрессии. Для расчетов параметра регрессии и по­строения графика в координатах Скэтчарда необхо­димо как минимум две точки, но для построения графиков с наименьшей ошибкой следует внести наибольшее возможное количество точек.

При экспортировании данных в Microsoft Office Excel они будут иметь частично кодирован­ный вид, что удобно для соединения с другой ба­зой данных, а также для статистического анализа результатов с помощью других программных при­ложений.

Таким образом, создана новая оригинальная программа, не имеющая аналогов в Беларуси, ко­торая позволяет производить расчеты параметров рецепторного связывания в координатах Скэтчар­да, с возможностью экспортировать расчетные по­казатели в виде таблицы или другую базу с данны­ми обследованных пациентов.


Область применения: в химических и биохимических исследованиях, где необходимо проводить построение графиков в координатах Скэтчарда.
Рекомендации по использованию: ЦНИЛ БелМАПО, Институт биоорганической химии НАН Беларуси.
Предложения по сотрудничеству: целесообразно сотрудничество с химическими и биохимическими лабораториями академических институтов.


в начало med.by баннеры учреждения авторы расширенный поиск
Достижения медицинской науки Беларуси.
Copyright © 1997-2020 НИО РНМБ
Вопросы и комментарии просьба отправлять Администратору сайта