УДК: 578.823.91(476)
Год издания: 2011

Банк изолятов ротавирусов различных G-P- типов и информационный ресурс «Характеристика изолятов ротавирусов, выделенных в Республике Беларусь»

Плотникова К.Ю.Виринская А.С.Новацкая Ю.В.Ефимов А.В.Гудков В.Г.
Рубрики: 34.25.0034.25.39
Республиканский научно-практический центр эпидемиологии и микробиологии
Тема НИР: «Разработать систему дозорного эпидемиологического надзора с подсистемами молекулярно-эпидемиологического и серологического мониторинга с целью усовершенствования эпидемиологического надзора и снижения заболеваемости ротавирусной инфекцией в республике»
Сроки выполнения НИР: январь 2009 г. —декабрь 2010 г.
Научный руководитель: канд. мед. наук, доц. В.Г. Гудков
Источник финансирования: госбюджет

Молекулярно-эпидемиологический мониторинг по­пуляции ротавирусов является важным компонентом современной системы эпидемиологического надзора за ротавирусной инфекцией. С целью последующего анализа и проведения дополнительных исследований генетические варианты возбудителя накапливаются в пополняемом банке изолятов ротавирусов, а результа­ты мониторирования отражаются в соответствующем информационном ресурсе.

С этой целью проводилось типирование изолятов ротавирусов методом мультиплексной однораундо­вой ПЦР по генам, кодирующим структурные бел­ки вириона VP4 и VP7. Последний является главным гликопротеиновым антигеном внешней оболочки, и определяемый им серотип обозначается как G-тип. VP4 обозначается как Р-тип.

Материалом для исследования служили пробы фе­калий детей с лабораторно подтвержденным диагнозом РВИ, поступившими из различных регионов республи­ки. Исследован 301 образец фекалий, собранный за период 2005-2010 гг. с показателем оптической плот­ности в ИФА на наличие ротавирусного антигена не менее 2.0 о.е.

Выделенные изоляты ротавирусов имели различные G и P генотипы и их сочетания. Наиболее часто, у 221 (73,4%) изолята, определялся генотип Р8. 78 (25,9%) изолятов имели генотип Р4, 2 (0,7%) - Р9. G-генотип исследованных изолятов ротавирусов отличался боль­шим разнообразием. Были выявлены 5 G-генотипов ротавирусов: G1 - 34 изолята, G2 - 76, G3 - 25, G4 - 162, G9 - 2, G4+G3 - 2 изолята. Распределе­ние исследованных изолятов ротавирусов по обеим генотипическим группам за 2005-2010гг. выглядело следующим образом: G1P8 - 34 (11,4%), G3P8 - 23 (7,6%), G4P8 - 161 (53,5%), G9P8 - 2 (0,7%), G2P4 - 76 (25,25%), G4P4 - 1 (0,3%), G4+G3 Р8 - 1 (0,3%), G4+G3 Р8 - 1 (0,3%).

Таким образом, доминантными G-P-типами явля­ются G4P8 (53,5%) и G2P4 (25,25%). Среди G-типов превалирует G4 (53,8%), а среди P-типов - P8 (73,4%).

Создан банк изолятов ротавирусов, выделенных во всех регионах Республики Беларусь: г. Минск - 170 изолятов, Брестская область - 34, Витебская - 21 изолят, Гомельская - 15, Гродненская - 13, Мин­ская - 9, Могилевская - 39 изолятов.

Полученные данные о популяции ротавирусов в ре­спублике размещены в специально разработанном ин­формационном ресурсе (ИР) «Характеристика изоля­тов ротавирусов, выделенных в Республике Беларусь», позволяющем систематизировать и автоматизировать обработку информации.

ИР разработан на матрице MS Access 2007, являю­щейся составной частью пакета Microsoft Office 2007 и характеризуется удобством и наглядностью интер­фейса, наличием хорошо организованной справочной системы, большим количеством мастеров и подска­зок, взаимосвязанностью с остальными компонентами Microsoft Office 2007.

Microsoft Office Access 2007 служит для создания и управления реляционными БД, где вся первичная ин­формация хранится в виде таблиц. ИР «Характеристи­ка ротавирусов, выделенных в Республике Беларусь» является реляционной базой данных: она представля­ет собой таблицы, связанные между собой. Создание связи между таблицами позволяет поддерживать ссы­лочную целостность, анализировать и формировать от­четы по данным из нескольких таблиц.

БД содержит следующие таблицы: материал, вид материала, пациент (контактный), диагноз, учреж­дения, Р-тип, G-тип. ИР содержит также следующие формы: заставка, главная, характеристика образца, све­дения о пациенте (контактном), характеристика возбу­дителя, ввод и изменение данных, изоляты, пациенты, учреждения.

Таким образом, в Республике Беларусь организован молекулярно-эпидемиологический мониторинг попу­ляции ротавирусов, проведено генотипирование 301 изолята этого возбудителя по G- и Р-типам, создан банк изолятов ротавирусов, выделенных во всех регионах страны. На матрице MS Access 2007 разработан соот­ветствующий информационный ресурс, зарегистриро­ваный в Государственном регистре информационных ресурсов Республики Беларусь (рег. свидетельство №1761000917 от 15.06.2010 г.).


Область применения: эпидемиологический надзор за ротавирусной инфекцией, научные исследования.
Рекомендации по использованию: в системе эпидемиологического надзора за ротавирусной инфекцией, в научных исследованиях.
Предложения по сотрудничеству: консультативная помощь при внедрении; обмен информацией по характеристике популяции ротавирусов, циркулируюшей в различных странах; совместные исследования в области молекулярно-эпидемиологического мониторинга, изучение свойств различных генетических вариантов ротавирусов и эффективности иммунобиологических препаратов.


в начало med.by баннеры учреждения авторы расширенный поиск
Достижения медицинской науки Беларуси.
Copyright © 1997-2019 НИО РНМБ
Вопросы и комментарии просьба отправлять Администратору сайта