УДК: 575.224.23:577.21-026.616
Год издания: 2011
Технология ДНК-диагностики числовых аномалий хромосом человека на основе флуоресцентной количественной ПЦР
Осадчук Т.В., Моссэ К.А.
Рубрики: 76.03.39
Республиканский научно-практический центр "Мать и дитя"
Тема НИР: «Разработать и внедрить в медицинскую практику технологию ДНК-диагностики числовых аномалий хромосом человека на основе флуоресцентной количественной ПЦР»
Сроки выполнения НИР: январь 2010 г. — декабрь 2012 г.
Научный руководитель: мед. наук, доц. К.У. Вильчук
Источник финансирования: госбюджет
Цель исследования: разработка и внедрение эффективной технологии диагностики наиболее частых числовых аномалий хромосом человека с применением инновационной технологии ДНК-анализа.
Числовые аномалии хромосом человека (анеуплоидии) являются самой частой причиной врожденной патологии человека. Частота трисомии хромосомы 21 (синдром Дауна) составляет в Беларуси 1:740 новорожденных. Кроме того, в большинстве случаев наличие анеуплоидии у плода приводит к невынашиванию беременности и самопроизвольному аборту.
На сегодняшний день в нашей стране пренатальная и неонатальная диагностика числовых аномалий хромосом человека проводится методом цитогенетического кариотипирования, который является надежным и широко используется при выявлении хромосомных болезней. Тем не менее, он имеет существенные недостатки - большую трудоемкость, относительно высокую стоимость и, что особенно важно, длительность выполнения анализа (3-4 недели). При пренатальной диагностике скорость получения результатов имеет очень большое значение как для психологического состояния пациентов, так и для возможности более раннего прерывания беременности при обнаружении тяжелой хромосомной патологии.
Современные молекулярно-генетические технологии позволяют проводить эффективную диагностику анеуплоидий с применением ДНК-анализа, основанного на количественном определении аллелей внутрилокусных микросателлитных маркеров. Данный метод основан на мультиплексной ПЦР с использованием флуоресцентно-меченных праймеров. Суть метода заключается в том, что при анализе маркера, имеющего высокую степень полиморфизма, его аллели с большой вероятностью будут отличаться в каждом из исследуемых локусов генома пациента. Такой анализ позволяет увидеть столько аллелей маркера, сколько локусов или сцепленных с ним генов присутствует в геноме. В норме это число составляет 2 для локусов аутосомных хромосом и хромосомы X у женщин, и 1 для половых хромосом у мужчин. У пациентов с трисомиями маркеры будут иметь 3 аллеля за счет лишней хромосомы, а у пациентов с моносомиями маркеры будут иметь один аллель за счет отсутствия одной из хромосом.
Впервые в Беларуси разработан метод ДНК-диагностики наиболее частых хромосомных анеуплоидий (синдромов Дауна, Эдвардса, Патау, Тернера, Кляйнфельтера) с использованием мультиплексной ПЦР и автоматического капиллярного электрофореза на основе одновременного тестирования 14 микросателлитных маркеров хромосом 21, 13, 18, X, Y в ходе одного анализа. В качестве биологического материала использовали ДНК, выделенную из фрагментов мышечной ткани плодов с различными видами анеуплоидии, абортированных после установления патологии по данным УЗИ и цитогенетического анализа. Всего получена ДНК от 22 плодов. По результатам тестирования образцов ДНК от плодов с синдромом Дауна, Эдвардса, Патау, Тернера и Кляйнфельтера, изменение количественных характеристик по аллелям соответствующих хромосом было зафиксировано во всех образцах, что свидетельствует о высокой информативности разработанного протокола. Нами также проанализированы временные характеристики разработанного протокола. Показано, что результат ДНК-диагностики числовых аномалий хромосом человека при применении технологии флуоресцентной количественной ПЦР может быть получен менее чем через 4,5 ч после выполнения биопсии или амниоцентеза, что значительно сокращает время диагностики числовых аномалий хромосом человека.
Область применения: медицинская генетика, пренатальная диагностика.
Предложения по сотрудничеству: консультативная и диагностическая помощь пациентам кабинетов медико-генетического консультирования.