УДК: 616.34-022-036.11-036.22:578.5(476)
Год издания: 2014
Создание национальной системы молекулярно-эпидемиологического мониторинга за возбудителями норовирусной инфекции и базы данных их доминирующих генотипов
Поклонская Н.В., Амвросьева Т.В., Дедюля К.Л., Барановская Н.Н., Богуш З.Ф., Казинец О.Н.
Рубрики: 34.15.31, 76.03.41, 76.29.50
Республиканский научно-практический центр эпидемиологии и микробиологии
Тема НИР: «Разработать систему молекулярно-эпидемиологического мониторинга за возбудителями норовирусной инфекции и изучить циркуляцию их генотипов на территории Республики Беларусь» ГНТП «Инфекции и микробиологические нанотехнологии».
Сроки выполнения НИР: январь 2013 г. — декабрь 2015 г.
Научный руководитель: Т.В. Амвросьева.
Источник финансирования: госбюджет.
Норовирусы (НоВ) являются одними из доминирующих этиологических агентов острых кишечных инфекций (ОКИ) вирусной природы. В настоящее время по распространенности и частоте вызываемых ими заболеваний среди детского контингента НоВ уступают только ротавирусам, тогда как среди взрослых, особенно пожилых, они признаны главными этиологическими агентами ОКИ. Геном НоВ характеризуется высокой частотой мутаций, приводящих к регулярному возникновению новых вариантов вируса, способных быстро распространяться среди населения из-за отсутствия к ним иммунной прослойки. Среди многообразия циркулирующих НоВ выделяются отдельные их генотипы или даже субгенотипы, обладающие наибольшей контагиозностью и способностью вызывать многочисленные вспышки ОКИ. Быстрое выявление генотипов с высоким эпидемическим потенциалом и предотвращение их распространения является главной задачей молекулярно-эпидемиологического надзора за НоВ.
Целью настоящего исследования была разработка и внедрение в практическое здравоохранение национальной системы молекулярно-эпидемиологического мониторинга за циркулирующими на территории Республики Беларусь возбудителями норовирусной инфекции (НоВИ) с последующим установлением эпидемически значимых их генотипов и созданием соответствующей базы данных.
В ходе исследований установлен стабильно высокий вклад НоВ в заболеваемость вирусными ОКИ в 2009-2012 гг. (около 20,5% среди детей и взрослых). Наибольшая доля гастроэнтеритов НоВ этиологии зарегистрирована у детей зимой 2011 г. (39,6%), наименьшая - летом 2012 г. (7,3%). Показана доминирующая роль НоВ в развитии групповой заболеваемости: 81,8% эпизодов имели норовирусную этиологию, в т. ч. 72,7% были связаны с НоВ II геногруппы и 9,0% - с НоВ I геногруппы (63,6% эпизодов НоВ оказались единственными этиологическими агентами).
На основании обобщения и анализа теоретических и экспериментальных данных разработана национальная система молекулярно-эпидемиологического мониторинга за возбудителями НоВИ, учитывающая особенности организации и функционирования отечественного здравоохранения и существующей в республике системы эпиднадзора за инфекциями. Проведена адаптация и оптимизация методов молекулярно-эпидемиологических исследований, разработаны схема и алгоритм их использования с регламентацией показаний и порядка действий, объектов, методов, объемов и кратности исследований, а также с выдачей рекомендаций по оценке и интерпретации полученных результатов и указанием возможных проблем в работе и путей их разрешения.
Изучена молекулярная эпидемиология НоВ, циркулировавших в 2009-2013 гг., установлены генетические характеристики этиологических агентов 7 эпизодов групповой заболеваемости НоВИ. Проведен филогенетический анализ НоВ по 2-м информативным регионам генома и установлена генетическая структура их популяции: генотип GII.4 - 62,8%, GII.6 - 14,0%, GII.g-GII.12 - 11,6%, GII.g-GII.1 - 9,3%, GII.3 - 2,3%. Идентифицировано 2 рекомбинантных геноварианта НоВ, вызвавших спорадическую (GII.g-GII.12) и групповую (GII.g-GII.1) заболеваемость. Установлена циркуляция в Беларуси двух глобальных эпидемических геновариантов НоВ в пределах доминирующего генотипа GII.4, вызвавших спорадическую (GII.4 2006b) и групповую (GII.4 New Orleans 2009) заболеваемость НоВИ.
На основании полученных данных создана и зарегистрирована в Государственном регистре информационных ресурсов «База данных о генотипах норовирусов, циркулирующих на территории Республики Беларусь» (рег. свид. № 1761303599 от 02.09.2013), содержащая информацию о 157 НоВ, идентифицированных в 2009-2013 гг. в клиническом материале пациентов с НоВИ. Генетические характеристики включают информацию о геногруппе вируса (10 НоВ I геногруппы, в т. ч. 5 этиологических агентов вспышек и 5 спорадических случаев, а также 147 НоВ II геногруппы, из них 47 и 100 случаев соответственно). База данных содержит информацию о генотипе 41 НоВ, в т. ч. об 11 этиологических агентах вспышек и 30 НоВ, вызвавших спорадические случаи заболевания. Она включает следующие генотипы: GII.4 (26 изолятов), GII.3 (1), GII.6 (5), G IIg/II.12 (5) GII.1 (2), GIIg(2). Нуклеотидные последовательности 44 НоВ депонированы в международный GenBank (коды доступа KC137572- KC137589, KC153243- KC153246, KF137566- KF137572, JQ036290-JQ036299).
Полученные результаты легли в основу разработки инструкции по применению «Алгоритм лабораторной диагностики норовирусной инфекции», утвержденной в установленном порядке (рег. № 014-1213 от 25.03.2014). Инструкция предназначена для вирусологов, эпидемиологов, лаборантов, врачей лабораторной диагностики. В ней изложены порядок осуществления лабораторной диагностики НоВИ в условиях спорадической и групповой заболеваемости, методы исследований и алгоритм их применения, включая рекомендации по использованию результатов.
Область применения: клиническая лабораторная диагностика.
Рекомендации по использованию: разработанный алгоритм может быть использован в работе стационаров и отделений инфекционного профиля, а также лабораторий центров гигиены и эпидемиологии, располагающих соответствующим оборудованием и специалистами.
Предложения по сотрудничеству: консультативная и техническая помощь в генотипировании, филогенетическом и молекулярно-эпидемиологическом анализе возбудителей НоВИ.