УДК: 616.24-002.5-002.5[576.8:579.716.5]
Год издания: 2015

Генотипирование мультирезистентных штаммов m.tuberculosis, циркулирующих на территории Республики Беларусь, на основе MIRU-VNTR анализа

Слизень В.В.Суркова Л.К.Залуцкая О.М.
Рубрики: 76.29.53
Республиканский научно-практический центр пульмонологии и фтизиатрии
Тема НИР: «Провести молекулярный мониторинг генотипов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих на территории Республики Беларусь».
Сроки выполнения НИР: январь 2014 г. — декабрь 2015 г.
Научный руководитель: д-р мед. наук, проф. Л.К. Суркова.
Соисполнители: ГУ «Белорусский государственный медицинский университет».
Источник финансирования: госбюджет.

Цель- изучить особенности генетической структуры популяций мультирезистентных штаммов M.tuberculosis, выделенных от пациентов в Республике Беларусь, на основе MIRU-VNTR анализа.

Высокие показатели распространения множественно лекарственно-устойчивого (МЛУ) туберкулеза в Республике Беларусь могут быть связаны с распространением определенных генетических вариантов, к которым относятся M.tuberculosis генетического семейства Beijing. Штаммы данного генотипа отличаются высокой трансмиссивностью, в т.ч. в стационарах, ассоциацией с МЛУ и характеризуются способностью вызывать тяжелые трудноподдающиеся лечению случаи туберкулеза легких с высоким уровнем смертности.

Впервые в республике проведено MIRU-VNTR типирование (Variable Number of Tandem Repeats) 69 клинических изолятов M.tuberculosis на основе 15 локусов MIRU (MIRU 04, MIRU 40, MIRU 26, MIRU 10, MIRU 16, MIRU 31, ETR-A, ETR-S, Mtub04, QUB 26, Mtub21, QUB 4156, Mtub 39, Mtub 30, QUB 11b) с детекцией продукта ПЦР методом электрофореза в агарозном геле и секвенирующего капиллярного электрофореза.

Электрофорез позволял по размеру образуемых ампликонов идентифицировать количество повторов в VNTR локусах. В результате анализа для каждого штамма определялся цифровой профиль MIRU-VNTR повторов в 15 локусах. Цифровой код сравнивали со стандартной базой цифровых кодов генотипов с использованием международной базы генотипов MIRU-VNTR (http: //www.miru-intrplus.org/MIRU/index.faces).

C помощью MIRU-VNTR анализа установлено молекулярно-генетическое разнообразие клинических изолятов M.tuberculosis, выделенных на территории Республики Беларусь, среди которых доминирует Beijing (63,7% (n=44) мультирезистентных штаммов).

Высокая частота выделения генетически однородных множественно лекарственно-устойчивых штаммов M.tuberculosis свидетельствует об эпидемиологическом распространении клона Beijing в республике.

MIRU-VNTR-типирование по 15 локусам позволило отнести 25 (36,2%) изолятов M.tuberculosis в группу non-Beijing. Из этой группы к семейству «Т» принадлежали 10 (14,4%) изолятов M.tuberculosis, 4 (5,8%) были отнесены к генетическому семейству LAM.

В группе non-Beijing определить принадлежность 11 (15,9%) изолятов M.tuberculosis к генетической линии не удалось (неклассифицированные (unknown) согласно VNTR).

Для более полной характеристики вариабельности неклассифицированной группы необходимо использовать другие методы генотипирования - сполиготипирование.

Соотношение генотипов в популяции M.tuberculosis в Республике Беларусь существенно отличалось от других географических регионов (Европа, РФ, Латвия, Эстония, Украина).

В Республике Беларусь и г.Минске по сравнению с Европой отмечен значительно более высокий удельный вес штаммов M.tuberculosis, относящихся к Beijing.

На протяжении последних 10 лет доля штаммов Beijing в республике и г.Минске по данным сполиготипирования, проведенного в лабораториях за пределами республики, доминировала в популяции M.tuberculosis в пределах 40,0-44,0% (Н.В. Василенко, 2008, О.М. Залуцкая, М.Вийкандер и соавт., 2013).

Генотип Beijing остается доминирующим среди штаммов M.tuberculosis, но классифицируется согласно MIRU-VNTR более высокой распространенностью - 63,7%.

Высокая распространенность генотипа Beijing МТБ в республике, по данным MIRU-VNTR, отражает общую ситуацию в Российской Федерации в целом и в отдельных регионах.

В Республике Беларусь штаммы M.tuberculosis генотипа Beijing играют ключевую роль в распространении возбудителя туберкулеза с МЛУ.

Метод MIRU-VNTR, включающий набор 15 стандартных локусов, может быть рекомендован к широкому применению для генотипирования популяций микобактерий туберкулеза генетического семейства Beijing, так как отличается высокой дискриминирующей способностью, быстротой проведения и автоматизированным процессом учета.

MIRU-VNTR генотипирование можно использовать для отслеживания вспышки заболевания, определения пути передачи, повторного заражения и выявления лабораторной кросс-контаминации.


Область применения: фтизиатрия.
Рекомендации по использованию: результаты исследования могут быть внедрены в противотуберкулезных учреждениях здравоохранения республики.
Предложения по сотрудничеству: консультативная помощь при внедрении.


в начало med.by баннеры учреждения авторы расширенный поиск
Достижения медицинской науки Беларуси.
Copyright © 1997-2022 НИО РНМБ
Вопросы и комментарии просьба отправлять Администратору сайта