УДК: 616.915:576.8(047.3)(476), 616.915-036.22(047.3)(476)
Год издания: 2015

Молекулярно-генетический мониторинг циркуляции вирусов кори и краснухи

Самойлович Е.О.Семейко Г.В.Ермолович М.А.Свирчевская Е.Ю.
Рубрики: 76.03.4176.33.00
Республиканский научно-практический центр эпидемиологии и микробиологии
Тема НИР: «Научно обосновать комплекс мероприятий по совершенствованию надзора за циркуляцией вирусов кори и краснухи».
Сроки выполнения НИР: январь 2013 г. — декабрь 2015 г.
Научный руководитель: д-р мед. наук, проф. Е.О. Самойлович.
Источник финансирования: госбюджет.

Выполнение программы элиминации кори и краснухи диктует необходимость молекулярного изучения вирусов, изолированных от пациентов, и дальнейшего филогенетического анализа. Сравнение нуклеотидного состава белорусских вирусов с вирусами, представленными в международной базе данных, позволяет изучить пути трансмиссии и определить, является ли вирус завозным или имеет местное происхождение.

Цель- проведение молекулярно-генетического мониторинга циркуляции вирусов кори и краснухи в Республике Беларусь в 2013-2015 гг.

В течение января 2013 г. - августа 2015 г. в Республике Беларусь было выявлено 82 случая кори (16 - в 2013 г., 64 - в 2014, 2 - в 2015 г.) и 3 случая краснухи (по 1 случаю в 2013-2015 гг.). У всех пациентов диагноз был подтвержден лабораторно с использованием серологических (выявление IgM антител, нарастание концентрации IgG антител) и/или молекулярных (обнаружение РНК вируса в клиническом материале с использованием ОТ-ПЦР) методов исследования.

Генотипирование выполняли с помощью секвенирования С-терминальной области N-гена (450 нуклеотидов) вируса кори и Е1 гена (739 оснований) вируса краснухи. Генотипированию были подвергнуты 29 вирусов кори (12 - в 2013 г., 15 - в 2014 г., 2 - в 2015 г.), а также 3 вируса краснухи.

По результатам исследования было установлено, что 16 выявленных в 2013 г. случаев кори были вызваны вирусами 5 генетических вариантов (D8, Frankfurt; D8, Republic of Komi; D4, Manchester; D9, Yamanashi; B3). Среди обнаруженных случаев 12 являлись единичными не связанными между собой и в 2-х случаях были выявлены короткие цепочки передачи вирусов (D8, Frankfurt, и D9, Yamanashi): двое заболевших в семейных очагах, когда взрослые пациенты инфицировали непривитых детей в возрасте 11 мес. В 2014 г. в Республике Беларусь было зарегистрировано 64 случая кори, вызванных вирусами 4-х генетических вариантов (D8, Frankfurt; D8, Republic of Komi; D4, Manchester и В3). Для обоих вариантов D8 были выявлены цепочки передачи. Для варианта D8, Republic of Komi, цепочка передачи была короткой и включала 4 случая (две генерации вируса). Цепочка передачи варианта D8, Frankfurt, включала 58 случаев, циркуляция вируса продолжалась 3,5 мес., восстановления эндемичной передачи не произошло. Обнаруженные в 2014 г. варианты D4, Manchester и B3 дальнейшего распространения в стране не получили. Два случая кори, выявленные в 2015 г., были вызваны вирусами двух различных генотипов (D8, Rostov on Don и B3), которые также не получили дальнейшего распространения. По всем обнаруженным в Республике Беларусь вирусам кори информация депонирована в Международную базу данных MeaNS.

С учетом эпидемиологических данных и результатов генотипирования вирусов было установлено происхождение всех выявленных в стране случаев кори. В соответствии с определением ВОЗ (завозной случай кори - это случай заболевания у человека, имевшего контакт с источником инфекции за пределами данной страны за 7-18 дней до появления сыпи, на что указывают эпидемиологические и/или вирусологические данные), к завозным были отнесены 12 случаев кори: 8 - в 2013 г. (из Украины - 1, из Таиланда - 1, из Индонезии - 1, из Египта - 1, из России - 3 и из Объединенных Арабских Эмиратов - 1); 3 - в 2014 г. (из России - 2, из Украины - 1) и 1 - в 2015 г. (из Италии). Остальные 70 случаев (8 - в 2013 г., 61 - в 2014 г., 1 - в 2015 г.) были классифицированы как связанные с завозными.

Все 3 случая краснухи, выявленных в Республике Беларусь в течение 3-х лет наблюдения, случая краснухи не были связаны между собой. Цепочек передачи вируса не обнаружено. По эпидемиологическим данным случаи 2014 и 2015 гг. являлись завозными (из Польши и Китая соответственно). Амплификация РНК вируса краснухи в ОТ-ПЦР представляет определенные трудности, связанные с наличием множества стабильных вторичных структур в геноме. Если участок генома вируса и удается амплифицировать, количество полученного генетического материала часто оказывается недостаточным для секвенирования. В таких случаях несмотря на подтверждение диагноза «краснуха» с использованием ОТ-ПЦР определить генотип вируса и соответственно его происхождение не удается. В связи с этим установление генотипа вируса краснухи представляет огромную ценность для программы элиминации вируса. Все 3 выявленных в Беларуси случая краснухи были подтверждены как серологическими, так и молекулярными методами. Однако только в одном случае (2014 г., завозной из Польши) удалось установить генотип вируса - 2В. Этот вирус вошел в число 7 вирусов краснухи с установленным генотипом в 2014 г. в Европейском регионе в целом.

Полученные данные предоставили убедительные доказательства отсутствия эндемичной циркуляции вирусов как кори, так и краснухи на территории Республики Беларусь. По результатам оценки Европейской региональной комиссии по верификации элиминации кори и краснухи Республика Беларусь была отнесена к странам с прерванной передачей обоих вирусов - кори и краснухи. Несмотря на поставленную цель элиминации кори и краснухи в Европейском регионе к 2015 г. в настоящее время менее половины стран Европейского региона достигли этого статуса.


Область применения: молекулярная биология, вирусология, эпидемиология.
Рекомендации по использованию: разработанный комплекс мероприятий по мониторингу циркуляции вирусов кори и краснухи утвержден в виде СанПиН и используется в эпидемиологическом надзоре в Республике Беларусь.
Предложения по сотрудничеству: обмен информацией по нуклеотидному составу вирусов кори и краснухи между различными странами с использованием международных баз данных.


в начало med.by баннеры учреждения авторы расширенный поиск
Достижения медицинской науки Беларуси.
Copyright © 1997-2018 НИО РНМБ
Вопросы и комментарии просьба отправлять Администратору сайта