УДК: [616-006.6+616.1+616.9]-092:[575+577.1+616-097]
Год издания: 2015
Полиморфизм гена интерлейкина-28B по трем локусам среди белорусских пациентов с хроническим гепатитом С и 1 генотипом вируса
Мицура В.М., Воропаев Е.В., Жаворонок С.В., Осипкина О.В., Терешков Д.В.
Рубрики: 34.03.35, 34.03.37, 76.29.46
Гомельский государственный медицинский университет
Тема НИР: «Изучение патогенетических механизмов формирования онкологической, сердечно-сосудистой и инфекционной патологии на основании молекулярно-генетических, биохимических и иммунологических исследований».
Сроки выполнения НИР: январь 2014 г. — декабрь 2015 г.
Научный руководитель: канд. мед. наук, доц. Е.В. Воропаев.
Источник финансирования: госбюджет.
Цель:определение частоты встречаемости и прогностического значения полиморфизма гена интерлейкина-28B по трем локусам (rs8099917, rs12979860, rs12980275) среди белорусских пациентов с хроническим гепатитом С (ХГС), имеющих 1 генотип вируса гепатита С (ВГС).
Обследовано 80 пациентов с ХГС (66% мужчин, средний возраст 41,1±1,5 года, у всех 1 генотип ВГС), которые получали противовирусную терапию (ПВТ) с использованием стандартного (n=40) или пегилированного (n=40) интерферона в сочетании с рибавирином (IFN/RBV или PegIFN/RBV соответственно). Оценивался стойкий вирусологический ответ на лечение (СВО), который составил 25% для схемы IFN/RBV и 40% для схемы PegIFN/RBV. Полиморфизм трех локусов гена IL-28B (rs8099917, rs12979860, rs12980275) определялся с помощью метода ПЦР-ПДРФ (полиморфизм длин рестрикционных фрагментов). В качестве материала для исследований использовалась ДНК, выделенная из лейкоцитов периферической крови. Детекцию продуктов ПЦР проводили с помощью гель-электрофореза, достоверность полученных данных подтверждена с помощью мелтинга (плавления) рестрикционных фрагментов. Статистическая обработка полученных данных проводилась с помощью программы STATISTICA v.6.0. Использовались критерий χ2 или точный критерий Фишера для сравнения частот в квадратах 2х2. Статистически значимой считалась 95% вероятность различий (р<0,05). Для расчета 95% доверительного интервала (95% ДИ) в оценке долей использован откорректированный метод Вальда.
Впервые установлена среди пациентов с ХГС в белорусской популяции, имеющих 1 генотип ВГС, частота носительства аллельных вариантов полиморфизма гена IL-28В по трем локусам.
При анализе полиморфизма rs8099917 установлена частота встречаемости аллельных вариантов ТТ (36,3%; 95% ДИ 26,6-47,2), TG (56,3%; 45,3-66,6) и GG (7,5%; 3,2-15,7). Среди лиц с генотипом ТТ ответили на терапию 58,6% (95% ДИ 40,7-74,5), а среди лиц с генотипами TG/GG - 17,7% (95% ДИ 9,3-30,5), что статистически значимо (χ2=12,3; р<0,001), отношение шансов (ОШ) = 6,6 (95% ДИ 2,4-18,5).
Частота встречаемости аллельных вариантов полиморфизма rs12979860: СС - 21,3% (95% ДИ 13,6-31,5), СТ - 63,8% (52,8-73,5), ТТ - 15% (8,6-24,6). Ответили на терапию 82,4% (58,2-94,6) лиц с генотипом СС и 19,1% (11,1-30,6) лиц с генотипами СТ/ТТ (р<0,001, точный критерий Фишера), ОШ = 19,8 (4,9-80,1).
Полиморфизм rs12980275 представлен генотипами АА (23,8%; 15,7-34,2), AG (58,8%; 47,8-68,9) и GG (17,5%; 10,6-27,4). На терапию ответили 63,2% (40,9-81,0) лиц с генотипом АА и 23,0% (14,1-35,0) - с генотипами AG/GG (χ2=8,9; р=0,003), ОШ = 5,8 (1,9-17,4).
Среди лиц с «благоприятными» аллельными вариантами полиморфизма гена IL-28B статистически значимых различий по частоте СВО между схемами IFN/RBV и PegIFN/RBV выявлено не было (р>0,05).
Определение достоверных предикторов ответа на противовирусную терапию ХГС позволяет выбрать оптимальную по клиническим и экономическим параметрам схему лечения.
Терапия IFN/RBV или PegIFN/RBV не является оптимальной для пациентов с 1 генотипом ВГС, однако все еще широко применяется в странах СНГ, где современные противовирусные препараты прямого действия недоступны или имеют чрезмерно высокую стоимость.
Частота «прогностически благоприятных» аллельных вариантов полиморфизма гена IL-28В сравнительно невысока (36, 21 и 24%). Все 3 исследованных полиморфизма обладают высокой прогностической ценностью при прогнозировании ответа на ПВТ IFN/RBV или PegIFN/RBV у обследованных, наибольшей прогностической значимостью обладает rs12979860. После тестирования на полиморфизм гена интерлейкина-28B (rs12979860, rs8099917, rs12980275) и у лиц с «благоприятными» аллельными вариантами следует ожидать достаточно высокой частоты ответа на терапию пегилированными или «стандартными» интерферонами, стоимость которых значительно меньше. Остальные пациенты могут считаться кандидатами на противовирусную терапию препаратами прямого действия.
Область применения: инфекционные болезни, лабораторная диагностика, фармакогенетика.
Рекомендации по использованию: полученные результаты могут применяться в практике инфекционных болезней для прогноза эффективности лечения и отбора группы пациентов на терапию с использованием противовирусных препаратов прямого действия, в целях планирования медицинской помощи пациентам с ХГС с учетом фармакогенетических параметров, а также в фундаментальных и прикладных исследованиях в области молекулярной эпидемиологии и лабораторной диагностики.
Предложения по сотрудничеству: совместные исследования в области фармакогенетики при лечении ХГС, консультативная помощь при внедрении.