![]() |
УДК: 616.915:576.8(047.3)(476), 616.915-036.22(047.3)(476), 578.831.
Год издания: 2019
Совершенствование молекулярно-эпидемиологического мониторинга кори и краснухи в Республике Беларусь
Самойлович Е.О., Семейко Г.В., Ермолович М.А., Свирчевская Е.Ю.
Рубрики: 76.03.41, 76.33.00
Республиканский научно-практический центр эпидемиологии и микробиологии
Тема НИР: «Разработать и внедрить алгоритмы ускоренной молекулярной детекции и идентификации вирусов полиомиелита, кори и краснухи с целью совершенствования молекулярно-эпидемиологического мониторинга».
Сроки выполнения НИР: июль 2016 г. — июнь 2019 г.
Научный руководитель: д-р мед. наук, проф. Е.О. Самойлович.
Источник финансирования: госбюджет.
Несмотря на поставленную цель элиминации кори и краснухи в Европейском регионе, в последние годы ситуация по кори является неблагополучной. В 2018 г. было зарегистрировано более 80 000 случаев кори, что в 4 раза выше в сравнении с 2017 г. и в 15 раз выше в сравнении с 2016 г. В 2019 г. как в мире в целом, так и Европейском регионе ВОЗ продолжился рост заболеваемости этой инфекцией. Сложившаяся ситуация отразилась и на Республике Беларусь, где с 2018 г. также отмечается рост заболеваемости корью. Выполнение программы элиминации кори и краснухи диктует необходимость разработки и внедрения алгоритмов ускоренной диагностики этих инфекций и молекулярного изучения выявленных вирусов с целью определения их происхождения.
Цель исследования - разработать и внедрить алгоритмы ускоренной идентификации вирусов кори и краснухи, соответствующие современным международным стандартам, и провести молекулярно-эпидемиологический мониторинг вызываемых ими инфекций.
В рамках данного проекта были разработаны одностадийная ОТ-ПЦР в режиме реального времени для детекции вируса кори и одностадийная ОТ-ПЦР в режиме реального времени для детекции вируса краснухи всех актуальных на сегодняшний день генотипов. Уменьшение количества этапов молекулярных исследований привело к сокращению времени детекции вирусов, снизило материалоемкость исследования за счет отсутствия расхода реагентов и материалов на дополнительные этапы. Внедрение данных методов в работу Республиканской референс-лаборатории по диагностике кори и краснухи позволило оптимизировать диагностику данных инфекций в стране. Наряду с разработкой методов одностадийной ОТ-ПЦР в режиме реального времени для детекции вирусов кори и краснухи систематизированы в целом подходы к диагностике этих инфекций (рационализировано использование серологических и молекулярных методов, определены оптимальные сроки забора материала, методы исследования и т. д.) и генотипированию их возбудителей, что нашло отражение в разработанной инструкции по применению «Методы лабораторной диагностики кори и краснухи и генотипирования возбудителей» (регистрационный № 022-1118, утверждена 19.12.2018). С использованием разработанных подходов проведен молекулярно-эпидемиологический мониторинг кори и краснухи.
В течение трех лет наблюдения (2016-2018 гг.) при обследовании подозрительных на корь и краснуху 1420 пациентов (с температурой и сыпью) выявлено 133 случая кори в 2016 г. (из них 10 - среди граждан республики и 123 - среди международных мигрантов), 1 случай кори и 1 случай краснухи - в 2017 г., 259 случаев кори и 2 случая краснухи - в 2018 г. Секвенирование фрагмента N гена 41 вируса кори (9 - 2016 г., 1 - 2017 г., 31 - 2018 г.) показало, что они относились к следующим генетическим вариантам: 2016 г. - D8-Frankfurt, H1, D8-Cambridge; 2017 г. - D8; 2018 г. - D8-Gir Somnath (2 варианта), D8-Cambridge, B3-Dublin. Секвенирование фрагмента Е1 гена 2 вирусов краснухи показало, что один из них принадлежал к генотипу 1Е (2017 г.), другой - к генотипу 2В (2018 г.). На основании эпидемиологических данных и результатов молекулярных исследований доказаны многократные завозы вируса кори на территорию Республики Беларусь с ограниченным их распространением и редкие завозы вируса краснухи без распространения.
Нуклеотидные последовательности 41 вируса кори и 2 вирусов краснухи депонированы в международные базы данных MeaNS и RubeNS.
Получены убедительные доказательства отсутствия эндемичной циркуляции вируса краснухи на территории Республики Беларусь. В отношении вируса кори ситуация представляется более сложной и требует продолжения молекулярных исследований вирусов, выявленных на территории Республики Беларусь. Циркуляция вируса одного и того же генотипа на территории страны на протяжении 12 мес. и более расценивается как эндемичная. Постоянный комплексный анализ эпидемиологических и молекулярно-генетических данных требуется для дифференциации местных и завозных случаев заболевания.
Область применения: молекулярная биология, вирусология, эпидемиология.
Рекомендации по использованию: разработанный алгоритм диагностики кори с применением методов ускоренной молекулярной детекции и идентификации используется в эпидемиологическом надзоре за корью и краснухой в Республике Беларусь.
Предложения по сотрудничеству: обмен информацией по нуклеотидному составу вирусов кори и краснухи с использованием международных баз данных.